学习资源网 问答 生信数据库

生信数据库

时间: 2022-10-28 02:57:56  知识小顽童

一、NR/NT数据库。NR(Non-Redundant Protein Sequence Database)非冗余蛋白库,所有GenBank+EMBL+DDBJ+PDB中的非冗余蛋白序列,对于所有已知的或可能的编码序列,NR记录中都给出了相应的 氨基酸序列 (通过已知或可能的读码框推断而来)以及专门蛋白数据库中的序列号。NR库相当于 一个以核酸序列为基础的交叉索引 ,将核酸数据和蛋白数据联系起来。NT(Nucleotide Sequence Database),核酸序列数据库,是NR库的子集。

二、COG数据库。蛋白质直系同源簇(Clusters of Orthologous Groups of proteins)

三、Swiss-Prot数据库。Swiss-Prot蛋白质序列数据库(Swiss-Prot Protein Sequence Database),由欧洲分子生物学实验室主持建立的蛋白质序列数据库。目前已合并入 UniProt数据库。

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